Toyota Fortuner được tổ chức ASEAN NCAP đánh giá 5 sao về mức độ an toàn. Với 2 phiên bản 2.8L được tính hợp gói công nghệ an toàn TOYOTA SAFETY SENSE với những tính năng đỉnh cao như:

• Hệ thống cảnh báo tiền va chạm PCS chủ động phát hiện va chạm có thể xảy ra với phương tiện khác, từ đó kích hoạt tính năng phanh hỗ trợ khi người lái đạp phanh hoặc tự động phanh trong trường hợp khẩn cấp
• Hệ thống điều khiển hành trình chủ động DRCC sử dụng radar gắn dưới lưới tản nhiệt phía trước kết hợp cũng với camera để phát hiện các phương tiện phía trước đồng thời tự điều chỉnh tốc độ để đảm bảo khoảng cách an toàn giữa các phương tiện đang lưu thông trên đường
• Hệ thống cảnh báo lệch làn đường LDA cảnh báo người lái bằng âm thanh và đèn hiệu cảnh báo trong trường hợp tài xế chuyển làn mà không bật tín hiệu rẽ.

Ngoài ra xe cũng được trang bị các tinh năng an toàn tiêu chuẩn như:

• Cảm biến hỗ trợ đỗ xe
• Hỗ trợ khởi hành ngang dốc
• Hỗ trợ khởi hành xuống dốc
• Hệ thống kiểm soát lực kéo
• Hệ thống cân bằng điện tử VSC với công tắc tắt OFF
• Khung xe GOA
• Hệ thống 7 túi khí
• Hệ thống phanh ABS/EBD/BA